Cases

典型项目案例

以下为可公开展示的项目类型示例，体现我们在科研计算流程设计、结果分析和报告交付方面的能力。

分子动力学模拟轨迹分析、自由能景观和能量分解图
分子动力学模拟

蛋白-配体复合物稳定性
与结合自由能分析

对多个候选化合物进行 100 ns 级别轨迹分析，结合 RMSD、RMSF、Rg、SASA、自由能景观、MM/GBSA 能量贡献和关键残基分解，评估复合物稳定性和潜在活性差异。

  • 交付模拟指标图、自由能图和残基贡献图
  • 输出可用于论文和汇报的结果解释
分子对接结合模式与二维相互作用示意图
分子对接

候选小分子结合模式解析

展示蛋白-配体三维结合构象、局部活性位点放大图和二维相互作用网络，帮助识别氢键、疏水作用和关键结合残基。

蛋白对接结合位点预测和局部口袋分析图
结合位点预测

蛋白复合物界面
与潜在结合口袋定位

围绕蛋白复合物界面进行口袋识别、局部残基标注和关键区域可视化，为后续分子对接、突变设计或机制解释提供依据。

Cas12a-crRNA-dsDNA 三元复合物建模分析图
分子建模

核酸-蛋白三元复合物建模
与结构比较

构建 Cas12a-crRNA-dsDNA 复合体系，比较不同底物长度和延伸序列下的三维结构差异，为后续模拟和机制研究准备可靠模型。

膜蛋白粗粒化模拟中的分子结合状态图
膜蛋白模拟

膜环境中配体结合状态
与通道区域分析

在膜蛋白体系中追踪小分子与膜脂相关组分的空间分布和结合状态，展示关键时间点构象与结合位点，为机制假设提供结构证据。